Aptera leží na západě Kréty, vzdálená asi 9 kilometrů východně od města Chania nad výběžkem Souda a patří k Apokoronas. Na nádhernou pláž Almirida je to odtud 4 kilometry a 6,5 kilometrů je vzdálená pláž u střediska Kalives. Aptera leží v nadmořské výšce 250 metrů. Díky své strategické poloze byla Aptera osídlena již v době antiky, proto zde můžeme obdivovat památky jak z doby mykénské, dórské, tak také z období byzantského. Dostatek vody, grandiozní pohled na výběžek Souda a strategicky dobrá poloha, to vše byly dobré důvody k založení Aptery.